在夫妻离婚时，有两个孩子的抚养权判决主要依据《中华人民共和国民法典》的相关规定。以下是具体的判决原则：
两周岁以下的子女
原则上由母亲直接抚养，除非母亲存在重大疾病、传染病或其他严重疾病，或者不想抚养孩子等不利于孩子成长的情况，这时孩子可以随父亲生活。
两周岁到八周岁之间的子女
法院会综合考虑双方的经济条件、生活环境、教育背景、与孩子的感情联系等因素，以判断哪一方更有利于孩子的成长。此时，经济条件更好、能提供更好成长环境的一方更有可能获得抚养权。
八周岁以上的子女
法院会尊重孩子的真实意愿。如果孩子明确表示愿意跟随某一方生活，法院通常会尊重孩子的选择。
双方协商一致
如果夫妻双方能够就孩子抚养问题协商一致，法庭会按照双方的意见出具判决书。例如，双方都同意一个孩子跟爸爸，一个孩子跟妈妈，或者两个孩子都跟其中一方，法庭会尊重双方的意愿。
特殊情况
如果一方举证证明自己更合适抚养孩子，并且经济能力、身体状况等都更有利于孩子的成长，法院也可能判决两个孩子都归一方抚养。
建议
提前准备：在离婚过程中，夫妻双方应尽量通过协商达成一致，以减少诉讼的时间和精力消耗。
收集证据：如果协商无果，应提前收集相关证据，如经济状况、居住环境、孩子的意愿等，以便在法庭上有力地陈述自己的观点。
法律咨询：在离婚过程中，建议咨询专业律师，以获得更具体的法律建议和帮助。
通过以上原则和建议，夫妻双方可以更好地了解自己在离婚时孩子的抚养权问题，并做出更合适的选择。
