办理超市营业执照的流程如下：
预先核准名称
携带身份证、房产证、租房合同的复印件去当地工商部门先预先核准名称，确定店名。
办理健康证
去卫生监督部门为店主和员工办理健康证，以证明他们适合从事食品行业的工作。
申请食品流通许可证
准备好身份证、房产证、租房合同、健康证的复印件和名称核准通知书的复印件，去当地工商部门办理食品流通许可证。根据《食品安全法》，卖食品需要办理此证。
申请烟草专卖零售许可证
如果超市销售烟草制品，需要带上相关证件复印件去当地烟草局申请烟草专卖零售许可证。
办理营业执照
携带食品流通许可证复印件、烟草专卖零售许可证批准函、证件照、名称核准通知书原件、身份证复印件、房产证、租房合同的复印件去工商部门办理营业执照。材料齐全且符合要求的情况下，一般一周时间就能拿到营业执照。
申请税务登记证
拿到营业执照30天内，携带营业执照正副本原件、租赁合同原件和复印件、身份证原件和复印件去地税、国税部门申请《税务登记证》。
办理组织机构代码证（如需要）：
根据实际需要决定是否去当地县区级的质量技术监督管理局办理组织机构代码证，需要的话，带上营业执照正副本原件、身份证原件和复印件，去质监局办理即可。
建议：
尽量提前准备好所有需要的材料，以确保流程顺利进行。
如果超市销售烟草制品，务必提前申请烟草专卖零售许可证。
可以选择线上或线下方式办理，具体流程和所需材料可能会有差异，建议提前咨询当地工商部门和烟草局。
