处理厂房违章建筑通常遵循以下步骤和原则：
审查合法性
收集相关合法证据，如政府同意建设的文件。
审查政府行政行为
确认违章建筑认定和拆除的依据、程序是否合法。
法律救济途径
聘请专业律师介入，通过行政复议或行政诉讼进行权利救济。
收集证据
准备强拆证据，如报警记录、拍照、录像等。
处罚措施
罚款：根据《中华人民共和国城乡规划法》，违建可处以临时建设工程造价一倍以下的罚款。
拆除：若违建无法通过改正措施消除影响，则限期拆除，不能拆除的，可没收实物或违法收入。
实施拆除
遵循《行政强制法》的程序，确保通知和公告到位，避免在夜间等不适宜的时间段进行拆除。
补偿问题
即使是违章建筑，如果违反法律程序进行强拆，也可以依法要求对合法财产的损害进行赔偿。
请根据具体情况采取相应措施，并咨询专业律师以获得更具体的法律建议
