虚开发票的查出方法主要包括以下几个方面：
银行流水检查
大额资金公转私或资金流水与持卡人身份不相符等情况会被推送到税务局，进而引发稽查。
上下游企业核查
上游企业被查出虚开，作为受票方的你被要求协查。下游客户数量多且杂乱、空壳公司无个人所得税扣缴、入库税款金额过低、购销金额与品名严重不匹配、无三方协议、逾期不申报或走逃失联、法定代表人及财务负责人联系不上、资金快进快出且都转入个人账户等情况也会引起注意。
大数据分析
进销不匹配、特殊发票金额较大且占比过高、接受自然人或个体开票的金额或份数异常且占比过高、新开企业开票异常迅速注销等情况会被大数据分析识别出。
举报与投诉
知情人士对虚开发票行为进行举报和投诉，相关部门在接到举报和投诉后，会依法进行调查处理。
合同检查
税务局会检查合同，确认是否存在虚拟购货、签订假合同或根本没有采购合同的情况。
入库单和货运单据检查
检查是否有入库单或制造假入库单，以及相关的收发货运单据。
账目检查
进销存账目记载混乱、对应关系不清，以及应付账款科目异常也会引起怀疑。
用电量和水量检查
针对生产性企业，通过查看电表和水表了解用电量和水量，与企业申报的销售收入进行匹配，判断是否存在隐瞒收入偷税的情况。
现场核查
税务稽查人员会到生产企业现场，查看厂房规模、机器设备产能、员工人数等，判断其生产能力与开票信息是否相符。
资金走向核实
检查企业账户及相关个人账户流水，核实资金是否通过法人或特定个人账户回流给对方。
实物或合同核对
根据发票中的数量核对是否有实物存在，包括核对实物品名、规格、数量、单价及新旧程度，判断发票真伪。
大额费用事项调查
对金额较大、多次使用同一单位发票的现象，与银行、工商、税务部门联系，核对该单位是否在工商注册，是否将资金打入开票单位。
票据印章与经济活动发生地关系分析
报销的票据与印鉴单位所经营的产品有无关联，是否按票据版面的性质内容填写所购置的商品，判断发票真伪。
发票报销情况普查
对一个季度或半年以上时段内的发票报销情况进行普查、详查、顺查、逆查，发现疑点及时与税务部门联系，取得虚假发票的鉴定结论。
通过上述方法，税务局能够有效地查出虚开发票的行为，并依法依规进行处理。建议企业要遵守相关税收法规，确保发票的真实性和合法性，避免因虚开发票而引发不必要的法律风险。
