明朝时，安徽属于应天府，由南京直接管辖。明洪武元年即1368年，合肥改属中书省直隶庐州府，为府治。洪武十三年（1379年），合肥改属六部直隶庐州府，为府治。永乐十八年（1420年）置南京直隶，合肥属南京直隶庐州府，为府治。
明朝南直隶州府县图
清朝初年，设置江南省，大致包括如今的上海市、江苏省和安徽省。清康熙六年即1667年，正式撤销江南省，分为安徽和江苏两省，因安庆府为当时安徽境内的政治中心，徽州府为经济中心，故取两府首字而得安徽省省名。
康熙六年（1667年），江南左布政使司改为安徽布政使司（俗称安徽省），仍寄治江宁，后将近100年的时间，安徽省省会放在省外江宁，这在历史上，应为独此一例。乾隆二十五年（1760年），安徽省治由江宁移驻安庆，安庆始为省会。
咸丰三年（1853年），太平军占领安庆，清廷将省府迁庐州（今合肥），合肥做了8年的临时省府，太平军改安庆府为安庆郡。咸丰十一年（1861年），安徽省府迁回安庆。光绪三十四年（1908年），裁撤。
清嘉庆二十五年地图
1940年，安庆沦陷时，省会迁往六安。民国三十四年（1945年）抗战胜利后，国民政府将安徽省省会迁至合肥县，合肥成为当时安徽省的省会。民国三十七年（1948年）十二月，省会迁回安庆。
1952年，安徽省人民政府正式在合肥市成立，自此合肥成为安徽省的省会。
合肥在历史上，两度成为安徽省省会，清朝时期8年，民国时期3年。
安徽省地图
新中国成立后，合肥为什么会成为安徽省省会。
安庆市在安徽省内位置较偏，靠近湖北与江西，与江苏省南京市比较类似。安庆市三面环山，一面靠水，不利于城市的长远发展。安庆地处长江北岸，南京、武汉作为省会都处在长江沿岸，三个省相连，省会都处在长江两岸，上世纪50年代，于战略角度上不利。南京、武汉作为老牌省会，地位不可撼动，安庆在安徽省内的地位，比不上南京与武汉，只能舍安庆而选择其它。
当时合肥成为安徽省省会的时候，还是一个县城，市区面积太小，城市面貌破旧，基础设施薄弱，许多人对合肥成为省会，都心存顾虑。合肥从一个县城一跃升级为省会，一开始地位是不稳定的，直到1958年，毛主席来合肥视察，从战略角度留下一句，“合肥不错，为皖之中，从长考虑，似较适宜"，正是因为这两句话，统一了全省上下的思想，从这个时候起，合肥作为安徽省省会，地位终于牢固下来。
合肥市市貌
