农村合作医疗本丢失后，可以按照以下步骤进行补办：
预挂失
医疗保险卡丢失后，首先应进行预挂失，以防止他人冒用。预挂失可以通过电话、网络或社保服务网点办理，挂失后社保卡将停止结算功能，预挂失有效期为10天，超过后自动解挂。
正式挂失
如果需要补办新的社保卡，应办理正式挂失手续。挂失人需出示本人身份证，如果行动不便或高龄等特殊情况，可以委托他人代办，但需同时提供被委托人的身份证原件与复印件。
填写申请表
到村（社区居委会）填写《新型农村合作医疗医保卡遗失补办申请表》，并加盖村、镇公章。然后，携带相关证明材料如身份证、户口簿等到当地医管中心或新农合服务网点办理补办手续。
提交补办材料
在补办时，需要提供补办人的身份证原件及复印件、户口簿原件及复印件、以及可能的缴费原始发票等。
等待办理
提交申请后，需要等待一段时间（通常为15个工作日），期间补卡人需保留好领卡证明，作为补卡期间的临时就医凭证。
领取新卡
补办手续完成后，补卡人需携带本人的身份证和领卡证明到指定的社保卡服务网点领取新卡。
建议：
尽快办理挂失和补办手续，以免影响就医和医疗费用的报销。
如果行动不便，可以委托他人代办，但需确保所有相关手续和证明材料齐全。
