当员工申请劳动仲裁时，公司一般可以采取以下处理方式：
初步了解案件情况
领取并分析劳动者的劳动仲裁申请书及相关证据材料。
甄别劳动者提出的内容和要求是否真实合理，确认劳动仲裁的主体是否正确，以及双方是否成立劳动关系。
积极调解
若企业存在明显的违法行为，如未签订劳动合同、未缴纳社保、未按时发放工资或加班费、违法解除劳动合同等，建议积极与劳动者沟通协商解决，尽量达成调解协议，以减少企业损失。
调解不成积极应诉
若企业认为劳动者的申请事项没有法律依据或有争议，应积极应诉。企业需要在法定期限内提交答辩状和证据材料，并在开庭时积极陈述和辩论，维护企业的合法权益。
积极准备开庭
开庭前，企业需要确定开庭思路，准备好答辩状和相关证据材料，包括劳动合同、工资单、考勤记录等，以证明企业的立场和观点。对于劳动者主张没有法律依据的部分，要重点准备相关证据。
收到裁决后的处理
开完庭后，若企业对裁决结果满意，劳动仲裁案件可能会结束。但劳动者可能会向法院提起诉讼，企业需要准备应对法院诉讼。
及时领取法律文书
公司在接到应诉通知后，应及时领取答辩通知书、举证通知书及员工提交的仲裁申请书及证据副本，以便了解员工的诉求和证据，做好应对准备。
了解员工仲裁原因
仔细分析员工提出仲裁的具体原因，如未签合同、调岗降薪、绩效工资等问题，并自查公司是否存在违规行为。
针对员工主张进行调查
对员工的主张进行核实，确认其真实性，并搜集公司有利的证据进行反驳。同时，了解员工的工作情况、与公司是否存在矛盾等信息。
搜集证据和准备材料
在调查事实的同时，搜集和整理相关证据材料，包括劳动合同、考勤记录、工资发放凭证等，并围绕对方的诉求准备答辩书。
寻求专业意见
在了解基本情况后，可以咨询律师意见，对可能的结果进行初步判断，并制定应对方案，包括与对方谈判和解或积极应诉的策略。
协商沟通
若属于公司方原因，可以在庭前与员工协商，寻求和解，避免事态扩大。若能在开庭前达成和解，则可以避免进一步的开庭审理。
严格履行法律义务
对于新入职员工，要求签订书面劳动合同，并到劳动部门备案，确保劳动相关法律法规的执行。
通过以上步骤，公司可以更有效地应对员工的劳动仲裁申请，维护自身的合法权益。
